某项目管理机构采用了矩阵式组织结构。在其运行过程中发现，当职能部门与子项目部的指令出现矛盾时，对工作产生了不良影响。为了避免这种影响，宜采用的做法是(　　)。
A.将这种矛盾全部交给项目经理裁决
B.由相关部门自己解决这类问题
C.由接受指令的员工处理这类问题
D.明确以职能部门或子项目部为主的管理模式