平阳市双林县建龙化工厂是一家合伙企业。2004年5月，县国税局在进行税务检查时发现，建龙化工厂没有按照规定报告其全部银行账号。于是，县国税局依照其2003年发布的《关于加强税务管理的若干规定》(1354号文件)对化工厂作出了罚款2万元并责令停业整顿的行政处罚决定。甲公司不服，认为县国税局据以作出处罚决定的《关于加强税务管理的若干规定》违法，因此依法向复议机关提出复议申请。复议机关超过法定期限未作出复议决定，化工厂决定向人民法院提起行政诉讼。请问： 在诉讼过程中，县国税局改变了原来作出的行政处罚决定，但甲公司并未撤诉，此时法院是否应当驳回起诉