案情：A市甲区的新兴公司与B市乙区的云通公司签订了一份建材购销合同。约定：新兴公司供给云通公司一批建材，总货款为50万元；交货地点为位于C市丙区的某仓库。新兴公司分三次将合同约定中的建材在交货地点交付给云通公司，但云通公司只给付新兴公司货款 15万元，尚欠35万元未付。新兴公司多次追索未果，遂诉至法院。
问题：

假设新兴公司利用第6问所指的救济手段，在诉讼过程中法院得知云通公司与华宁公司之间的债权债务关系存在争议，并根据双方签订的仲裁协议正在进行仲裁，法院对新兴公司提起的诉讼应当如何处理