【分析解答题】

某施工场地是一片废墟，某施工单位通过招投标获得了工程的施工任务，并与建设单位签订了固定价格合同。在施工过程中，开挖基坑时发现地基条件与建设单位在招标文件中指出的已“三通一平”不符，仍有部分废墟。

根据修改的设计图纸，基坑开挖要加深加大，造成土方工程量增加，施工工效降低。在施工中又发现了较有价值的出土文物，造成承包商部分施工人员和机械窝工，同时承包商为保护文物付出了一定的措施费用。请问承包商应如何处理