某承包商通过资格预审后，对招标文件进行于仔细分析，发现招标单位所提出的工期要求过于苛刻，且合同条款中规定每拖延l天工期罚合同价的1%。若要保证实现该工期要求，必须采取特殊措施，从而大大增加成本；还发现原设计方案过于保守。因此，该承包商在投标文件中说明业主的工期要求难以实现，因而按自己认为的合理工期(比业主要求的工期增加6个月)编制施工进度计划并据此报价；还建议变更原设计方案，并对这两种设计方案进行了技术、经济分析和比较，证明变更原设计方案不仅能保证工程结构的可靠性和安全性、提高空间利用的灵活性，而且可降低造价约3%。该承包商将技术标和商务标分别封装，在封口处加盖本单位公章和项目经理签字后，在投标截止日期前1天上午将投标文件报送招标单位。次日(即投标截止日当天)下午，在规定的开标时间前1小时，该承包商又递交了一份补充材料，其中声明将原报价降低4%。但是，招标单位的有关工作人员认为，根据国际上“一标一投”的惯例，一个承包商不得递交两份投标文件，因而拒收承包商的补充材料。 开标会由市招投标办的工作人员主持，市公证处有关人员到会，各投标单位代表均到场。开标前，市公证处人员对各投标单位的资质进行审查，并对所有投标文件进行审查，确认所有投标文件均有效后，正式开标。主持人宣读投标单位名称、投标价格、投标工期和有关投标文件的重要说明。 问题 从所介绍的背景资料来看，在该项目招标程序中存在哪些问题 请分别做简单说明。