背景
某城市的通信建设单项工程包括5个单位工程，建设单位为了引进竞争机制，将此项目的5个单位工程分别进行招标。建设单位请长期与其合作的某施工单位编制了标底，并向20家施工单位发出了招标邀请函，这些单位都购买了标书，并按照建设单位的要求向其交纳了估算合同价2%的投标保证金。在投标截止日，有A,B两家施工单位因路上堵车而未按规定时间提交投标文件，经向建设单位解释，建设单位接受了两单位的标书。
在开标时，发现C施工单位的投标文件中对一个标段有两个报价。在开标结束后，C施工单位解释此问题是因为封装文件时疏忽所致，并说明了有效文件的版本。
此次评标决定以最接近标底法确定中标人。在评标时，评标委员会发现D施工单位的投标文件中的施工方案编制得比较优秀，只是其中的工作量与报价的内容不对应，因此，评标委员会请其对此问题做出澄清，以确定有效工作量。对于E施工单位的投标文件，评标委员会发现其中的工作量汇总时存在数据错误，因此请该单位对此进行补正。另外还有其他个别的投标文件也存在含义不清、文字错误等问题，评标委员会也都请他们做了必要的说明或澄清。
经建设单位的权衡，最终确定了A,B,C,D,E，5家施工单位分别中标一个单位工程。在签订合同时，建设单位请A施工单位再适当地把费用压低一些，A单位迫于无奈只好同意。最终建设单位与5家施工单位签订了施工合同。建设单位在合同签订一个月以后，向未中标的各施工单位退还了投标保证金。
由于建设单位资金紧张，工程开工后一直未按合同约定向各施工单位拨付进度款。各施工单位为了尽快完成此项目，分别垫资完成此工程。
未中标的施工单位在了解到此工程招标投标过程中的一些问题以后，欲对此建设单位的行为进行投诉。
问题
(1)建设单位在此次招标活动中有哪些违规行为?建设单位怎样做才正确?
(2)未中标的施工单位应向哪个部门投诉建设单位的违规行为?