A公司的职能部门与B公司订立保证合同为C公司提供担保，但是B公司并不知道与其签订保证合同的是A公司的职能部门，后因纠纷诉至人民法院，法院判决该保证合同无效，导致B公司发生了损失，根据规定，下列选项中正确的是( )。
A、由A公司向B公司承担民事责任
B、由A公司的职能部门向B公司承担民事责任
C、由A公司及其职能部门共同向B公司承担民事责任
D．由A公司和B公司根据其过错各自承担相应的民事责任