某市越江隧道工程全部由政府投资。该项目为该市建设规划的重要项目之一，且已列入地方年度固定资产投资计划，设计概算已经主管部门批准，施工图及有关技术资料齐全。该项目拟采用Bot方式建设，市政府正在与有意向的Bot项目公司洽谈。为赶工期政府方出面决定对该项目进行施工招标，因估计除本市施工企业参加投标外，还可能有外省市施工企业参加投标，故招标人委托咨询单位编制了两个标底，准备分别用于对本市和外省市施工企业投标价的评定。
招标过程中，招标人对投标人就招标文件所提出的所有问题统一作了书面答复，并以备忘录的形式分发给各投标人，为简明起见，采用表格形式见下表。

质疑答复备忘录 序号 问题 提问单位 提问时间 答复 1 … n

在书面答复投标人的提问后，招标人组织各投标人进行了施工现场踏勘。在投标截止日期前10天，招标人书面通知各投标人，由于市政府有关部门已从当天开始取消所有市内交通项目的收费，因此决定将收费站工程从原招标范围内删除。
[问题]
1．该项目的标底应采用什么方法编制？简述其理由。
2．该项目施工招标在哪些方面存在问题或不当之处？请逐一说明。
3．如果在评标过程中才决定删除收费站工程，应如何处理？